作為深圳中學直接管理的國際化教育機構，萬科梅沙書院構建了獨具特色的AP與A-Level雙軌課程系統。其中美融合課程采用分層教學模式，在保持AP課程學術嚴謹性的同時，增加跨學科項目實踐模塊。中英融合課程則引入英國私校教學法，通過模塊化學習強化學生核心學科能力。
語言教學方面除英語必修外，特別開設德語、西班牙語等小語種選修課，語言實驗室配備實時語音分析系統，支持學生進行精準發音矯正。課程評價體系采用形成性評估機制，重點關注學習過程的能力提升。
校區1.8萬平方米空間內，25間專業藝術教室均配置施坦威三角鋼琴，音樂教學區采用專業聲學設計。創新實踐中心包含3D打印實驗室、服裝設計工坊等特色空間，其中木工坊引進德國精密設備，支持學生進行家具設計實踐。
運動設施方面，除標準400米跑道和足球場外，特別建設符合國際賽事標準的室內恒溫泳池。帆船訓練基地配備專業級訓練艇，與深圳水上運動中心建立聯合培養機制。
目前116人專任教師團隊中，外籍及港臺教師占比達45%，核心學科教師均持有IB/AP認證。人文社科組教師團隊包含2名普林斯頓大學博士，理科教研組負責人具有加州理工學院研究背景。
藝術教師團隊由羅德島設計學院畢業生領銜，音樂學科配備伯克利音樂學院認證導師。升學指導中心配置8人專業團隊，采用大數據分析系統進行院校匹配。
當年畢業生累計收獲573封錄取，其中美國常春藤聯盟錄取14人次，創深圳地區國際學校新高。英國方向獲得帝國理工學院等G5院校錄取26人次，藝術類申請收獲帕森斯設計學院等院校offer 47封。
獎學金方面累計突破200萬美元，單項最高獲得南加州大學12萬美元獎學金。計算機科學專業錄取表現尤為突出，卡內基梅隆大學等院校錄取率達83%。
學校實施學術導師+升學顧問雙軌制，每位學生配備學科指導老師和專業規劃師。科技創新項目實行企業導師制，與騰訊、大疆等企業共建12個創新實驗室。
藝術培養采用工作室制教學，學生可自主選擇油畫、版畫等不同創作方向。表演藝術課程包含百老匯音樂劇排演項目，年度公演在大劇院專業舞臺舉行。
